Institut fŁr Medizinische Statistik - UMG

Dr. Manuel Nietert


Wissenschaftlicher Mitarbeiter - AG Statistische Bioinformatik
Telefon:
0551-39-4989
Telefax:
0551-39-4995
E-Mail:
Manuel.Nietert@med.uni-goettingen.de
Ort:
Humboldtallee 32, EG
ORCID iD:
ORCID iD iconorcid.org/0000-0001-5443-7943
Forschungsinteressen / - aktivitäten

Bio- und Chemieinformatik:
Drug Design, Liganden- und Rezeptor-basiertes Virtuelles Screening, RNA-Liganden-Wechselwirkung, Machine-Learning-Verfahren, künstliche Neuronale Netze, Selbst-organisierende Karten, Cluster-Verfahren, Pharmakophor-Modellierung, QSAR, Mustererkennung angewandt auf chemische Deskriptoren, Datenanalyse von Moleküldynamik-Simulationen, Durchflusszytometrie, Analyse von Zelltracks, Datenmanagement.

Projektarbeit:


Programmierung:
Java, MATLAB, SQL, Perl, Python, Shell-Scripting, C, R, KNIME, Grails, Groovy.
Kurzer Lebenslauf

[seit 09/2010] Wissenschaftlicher Mitarbeiter,
Universitätsmedizin, Göttingen
[08/2007 - 07/2009] Wissenschaftlicher Mitarbeiter,
Technische Universität Darmstadt
[08/2004 - 07/2007] Wissenschaftlicher Mitarbeiter,
Goethe-Universität Frankfurt am Main

Veröffentlichungen


1. Jo P, Bernhardt M, Nietert M, Azizian A, König A, Wolff HA, Schirmer M, Grade M, Ghadimi M, Ströbel P, Schildhaus HU, Gaedcke J KRAS Mutationstatus Konkordanz zwischen Primärtumor und der korrespondierenden Metastase in Patienten mit Rekumkarzinom. Z Gastroenterol 2018; 56(08): e338-e339 DOI: 10.1055/s-0038-1669022

2. Jo P, Kesruek H, Nietert M, Sahlmann C, Gaedcke J, Ghadimi M, Sperling J. Inzidenz und Pr√§diktive Faktoren des Bilateralen Papill√§ren Schilddr√ľsenkarzinoms. Zentralblatt f√ľr Chirurgie. 2018: accepted 07. 2018

3. Lowes M, Kleiss M, Lueck R, Detken S, Koenig A, Nietert M, Beissbarth T, Stanek K, Langer C, Ghadimi M, Conradi LC, Homayounfar K. The utilization of multidisciplinary tumor boards (MDT) in clinical routine: results of a health care research study focusing on patients with metastasized colorectal cancer. International journal of colorectal disease. 2017; PubMed [journal] PMID: 28779354, PMCID: PMC5596058

4. R√ľhlmann F, Nietert M, Sprenger T, Wolff HA, Homayounfar K, Middel P, Bohnenberger H, Beissbarth T, Ghadimi BM, Liersch T, Conradi LC. The Prognostic Value of Tyrosine Kinase SRC Expression in Locally Advanced Rectal Cancer. Journal of Cancer. 2017; 8(7):1229-1237. PubMed [journal] PMID: 28607598, PMCID: PMC5463438

5. Jo P, Nietert M, Gusky L, Kitz J, Conradi LC, M√ľller-Dornieden A, Sch√ľler P, Wolff HA, R√ľschoff J, Str√∂bel P, Grade M, Liersch T, Bei√übarth T, Ghadimi MB, Sax U, Gaedcke J. Neoadjuvant Therapy in Rectal Cancer - Biobanking of Preoperative Tumor Biopsies. Scientific reports. 2016; 6:35589. PubMed [journal] PMID: 27752113, PMCID: PMC5067705

6. Linke F, Harenberg M, Nietert MM, Zaunig S, von Bonin F, Arlt A, Szczepanowski M, Weich HA, Lutz S, Dullin C, Janovsk√° P, Krafńć√≠kov√° M, Trant√≠rek L, Ovesn√° P, Klapper W, Beissbarth T, Alves F, Bryja V, Tr√ľmper L, Wilting J, Kube D. Microenvironmental interactions between endothelial and lymphoma cells: a role for the canonical WNT pathway in Hodgkin lymphoma. Leukemia. 2017; 31(2):361-372. PubMed [journal] PMID: 27535218

7. Linke F, Zaunig S, Nietert MM, von Bonin F, Lutz S, Dullin C, Janovsk√° P, Beissbarth T, Alves F, Klapper W, Bryja V, Pukrop T, Tr√ľmper L, Wilting J, Kube D. WNT5A: a motility-promoting factor in Hodgkin lymphoma. Oncogene. 2017; 36(1):13-23. PubMed [journal] PMID: 27270428

8. Styczen H, Nagelmeier I, Beissbarth T, Nietert M, Homayounfar K, Sprenger T, Boczek U, Stanek K, Kitz J, Wolff HA, Ghadimi BM, Middel P, Liersch T, R√ľschoff J, Conradi LC. HER-2 and HER-3 expression in liver metastases of patients with colorectal cancer. Oncotarget. 2015; 6(17):15065-76. PubMed [journal] PMID: 25915155, PMCID: PMC4558136

8. von der Heyde S, Wagner S, Czerny A, Nietert M, Ludewig F, Salinas-Riester G, Arlt D, Beißbarth T. mRNA profiling reveals determinants of trastuzumab efficiency in HER2-positive breast cancer. PloS one. 2015; 10(2):e0117818. PubMed [journal] PMID: 25710561, PMCID: PMC4339844

10. Conradi LC, Styczen H, Sprenger T, Wolff HA, R√∂del C, Nietert M, Homayounfar K, Gaedcke J, Kitz J, Talaulicar R, Becker H, Ghadimi M, Middel P, Beissbarth T, R√ľschoff J, Liersch T. Frequency of HER-2 positivity in rectal cancer and prognosis. The American journal of surgical pathology. 2013; 37(4):522-31. PubMed [journal] PMID: 23282976

11. Tanrikulu Y, Nietert M, Scheffer U, Proschak E, Grabowski K, Schneider P, Weidlich M, Karas M, Göbel M, Schneider G. Scaffold hopping by "fuzzy" pharmacophores and its application to RNA targets. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2007; 8(16):1932-6. PubMed [journal] PMID: 17896338

12. Böcker A, Sasse BC, Nietert M, Stark H, Schneider G. GPCR targeted library design: novel dopamine D3 receptor ligands. ChemMedChem. 2007; 2(7):1000-5. PubMed [journal] PMID: 17477344

Prüfungsarbeiten


Nietert M (2008) - Dissertation: "Virtuelles Screening nach RNA-Liganden: zum Umgang mit einer flexiblen Zielstruktur", Goethe-Universität Frankfurt am Main.

Nietert M (2004) - Diplomarbeit: "Vorhersage der Blut-Hirnschrankengängigkeit von Molekülen mit künstlichen neuronalen Netzen", Goethe-Universität Frankfurt am Main.