Institut für Medizinische Statistik - UMG

Dr. Manuel Nietert


Wissenschaftlicher Mitarbeiter - AG Statistische Bioinformatik
Telefon:
0551-39-4989
Telefax:
0551-39-4995
E-Mail:
Manuel.Nietert@med.uni-goettingen.de
Ort:
Humboldtallee 32, EG
Forschungsinteressen / - aktivitäten

Bio- und Chemieinformatik:
Drug Design, Liganden- und Rezeptor-basiertes Virtuelles Screening, RNA-Liganden-Wechselwirkung, Machine-Learning-Verfahren, künstliche Neuronale Netze, Selbst-organisierende Karten, Cluster-Verfahren, Pharmakophor-Modellierung, QSAR, Mustererkennung angewandt auf chemische Deskriptoren, Datenanalyse von Moleküldynamik-Simulationen, Durchflusszytometrie, Analyse von Zelltracks, Datenmanagement.

Projektarbeit:


Programmierung:
Java, MATLAB, SQL, Perl, Python, Shell-Scripting, C, R, KNIME, Grails, Groovy.
Kurzer Lebenslauf

[seit 09/2010] Wissenschaftlicher Mitarbeiter,
Universitätsmedizin, Göttingen
[08/2007 - 07/2009] Wissenschaftlicher Mitarbeiter,
Technische Universität Darmstadt
[08/2004 - 07/2007] Wissenschaftlicher Mitarbeiter,
Goethe-Universität Frankfurt am Main

Veröffentlichungen


1. Lowes M, Kleiss M, Lueck R, Detken S, Koenig A, Nietert M, Beissbarth T, Stanek K, Langer C, Ghadimi M, Conradi LC, Homayounfar K. The utilization of multidisciplinary tumor boards (MDT) in clinical routine: results of a health care research study focusing on patients with metastasized colorectal cancer. International journal of colorectal disease. 2017; PubMed [journal] PMID: 28779354, PMCID: PMC5596058

2. Rühlmann F, Nietert M, Sprenger T, Wolff HA, Homayounfar K, Middel P, Bohnenberger H, Beissbarth T, Ghadimi BM, Liersch T, Conradi LC. The Prognostic Value of Tyrosine Kinase SRC Expression in Locally Advanced Rectal Cancer. Journal of Cancer. 2017; 8(7):1229-1237. PubMed [journal] PMID: 28607598, PMCID: PMC5463438

3. Jo P, Nietert M, Gusky L, Kitz J, Conradi LC, Müller-Dornieden A, Schüler P, Wolff HA, Rüschoff J, Ströbel P, Grade M, Liersch T, Beißbarth T, Ghadimi MB, Sax U, Gaedcke J. Neoadjuvant Therapy in Rectal Cancer - Biobanking of Preoperative Tumor Biopsies. Scientific reports. 2016; 6:35589. PubMed [journal] PMID: 27752113, PMCID: PMC5067705

4. Linke F, Harenberg M, Nietert MM, Zaunig S, von Bonin F, Arlt A, Szczepanowski M, Weich HA, Lutz S, Dullin C, Janovská P, Krafčíková M, Trantírek L, Ovesná P, Klapper W, Beissbarth T, Alves F, Bryja V, Trümper L, Wilting J, Kube D. Microenvironmental interactions between endothelial and lymphoma cells: a role for the canonical WNT pathway in Hodgkin lymphoma. Leukemia. 2017; 31(2):361-372. PubMed [journal] PMID: 27535218

5. Linke F, Zaunig S, Nietert MM, von Bonin F, Lutz S, Dullin C, Janovská P, Beissbarth T, Alves F, Klapper W, Bryja V, Pukrop T, Trümper L, Wilting J, Kube D. WNT5A: a motility-promoting factor in Hodgkin lymphoma. Oncogene. 2017; 36(1):13-23. PubMed [journal] PMID: 27270428

6. Styczen H, Nagelmeier I, Beissbarth T, Nietert M, Homayounfar K, Sprenger T, Boczek U, Stanek K, Kitz J, Wolff HA, Ghadimi BM, Middel P, Liersch T, Rüschoff J, Conradi LC. HER-2 and HER-3 expression in liver metastases of patients with colorectal cancer. Oncotarget. 2015; 6(17):15065-76. PubMed [journal] PMID: 25915155, PMCID: PMC4558136

7. von der Heyde S, Wagner S, Czerny A, Nietert M, Ludewig F, Salinas-Riester G, Arlt D, Beißbarth T. mRNA profiling reveals determinants of trastuzumab efficiency in HER2-positive breast cancer. PloS one. 2015; 10(2):e0117818. PubMed [journal] PMID: 25710561, PMCID: PMC4339844

8. Conradi LC, Styczen H, Sprenger T, Wolff HA, Rödel C, Nietert M, Homayounfar K, Gaedcke J, Kitz J, Talaulicar R, Becker H, Ghadimi M, Middel P, Beissbarth T, Rüschoff J, Liersch T. Frequency of HER-2 positivity in rectal cancer and prognosis. The American journal of surgical pathology. 2013; 37(4):522-31. PubMed [journal] PMID: 23282976

9. Tanrikulu Y, Nietert M, Scheffer U, Proschak E, Grabowski K, Schneider P, Weidlich M, Karas M, Göbel M, Schneider G. Scaffold hopping by "fuzzy" pharmacophores and its application to RNA targets. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2007; 8(16):1932-6. PubMed [journal] PMID: 17896338

10. Böcker A, Sasse BC, Nietert M, Stark H, Schneider G. GPCR targeted library design: novel dopamine D3 receptor ligands. ChemMedChem. 2007; 2(7):1000-5. PubMed [journal] PMID: 17477344

Prüfungsarbeiten


Nietert M (2008) - Dissertation: "Virtuelles Screening nach RNA-Liganden: zum Umgang mit einer flexiblen Zielstruktur", Goethe-Universität Frankfurt am Main.

Nietert M (2004) - Diplomarbeit: "Vorhersage der Blut-Hirnschrankengängigkeit von Molekülen mit künstlichen neuronalen Netzen", Goethe-Universität Frankfurt am Main.